Musterring hussen

30. Juli 2020 Allgemein

Mehrere Ansätze und Software-Tools existieren, die prototropen Tautomerismus behandeln können.3,7 Häufig, Sie ermöglichen die Aufzählung aller möglichen prototropen Tautomere, Identifizierung einer kanonischen Tautomer-Form einer Verbindung, oder beides. Unserer Kenntnis nach gehen aktuelle Chemoinformatik-Tools jedoch überhaupt nicht gut mit Ring-Ketten-Tautomerismus um. Daher werden wir in dieser Arbeit einen praktischen Ansatz zur Aufzählung und Vorhersage von Ringketten-Tautomern vorstellen. Tabelle 5 zeigt, dass die hier analysierten Naturprodukte und Arzneimitteldatenbanken tatsächlich eine deutlich höhere Eintrittsrate der Möglichkeit eines Ringketten-Tautomerismus aufweisen: im Durchschnitt genau das Doppelte des Wertes für die vier Naturprodukte/Arzneimitteldatenbanken (16%) gegenüber dem AMS (8%). Im Gegensatz dazu sind die Vorkommensraten für prototropen Tautomerismus etwas niedriger als beim AMS, wenn auch mit einem deutlich geringeren relativen Unterschied (Durchschnitt von 56% vs. 76% für AMS) als das ungefähr 2:1-Verhältnis, das wir für Ring-Ketten-Tautomerismus gefunden haben. Wenn der Ring-Ketten-Tautomerismus mehr als zwei Reaktionszentren umfasst (mehr als ein nucleophiles und/oder mehr als ein elektrophiles Zentrum), kann das Ergebnis als eine ring-ketten-ringttaumere Interkonversion beschrieben werden, die mindestens zwei Ring-Ketten-Gleichgewichte umfasst.48 Unter Berücksichtigung der Frage, dass jede Regel eine Transformation ist, ist es manchmal notwendig, mehrere Transformationen anzuwenden, um einen bestimmten Tautomer zu erhalten. Aus diesem Grund haben wir den Multistep-Modus in der tautomer-Generation verwendet (siehe oben). Am Ende dieses Prozesses wird ein Netzwerk erstellt, in dem jeder Knoten einen Tautomer darstellt und jede Verbindung (Kante) eine Transformationsregel ist, und die Art und Weise, wie sie sich in jedem Netzwerk bewegen können, ist das Anwenden von Transformationsschritten.

Die Situation wird immer komplizierter, da die Anzahl der Reaktionszentren zunimmt und infolgedessen die Anzahl der Kombinationen. Solche Netzwerke können sehr groß werden, mit mehreren Schritten erforderlich, um einen anderen experimentell gefundenen Tautomer zu erreichen. In den Literaturbeispielen, die wir untersuchten, fanden wir jedoch keinen Fall, in dem der Wechsel von einem experimentellen Tautomer zu einem anderen die Anwendung von mehr als zwei Transformationen erforderte. Vor diesem Hintergrund könnte man sich für eine maximale Anzahl von Transformationen entscheiden, die für die Erzeugung von Tautomern zulässig sind. Aus chemoformatischer Sicht ist es jedoch wichtig, alle möglichen Ringketten-Tautomer für eine bestimmte Verbindung durch die Vorhersageregeln zugänglich zu machen.

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